水的微生物分析包含两个部分：
A. 总微生物计数 致病菌检测
A. 微生物总计数：
1.0 过滤方法：
1.1 需过滤的水量取决于预期的微生物计数。若微生物计数较高，则应制备稀释系列样本。将过滤帽与真空泵组装在一起，构成过滤装置。
1.2 取下0.45微米孔径的无菌过滤装置的盖子 膜过滤器 （直径47毫米），并转移1毫升水 送入过滤单元。
1.3 启动真空泵，让样品流过膜过滤器。通过该过滤器过滤约100毫升的无菌0.1%蛋白胨水以清洗膜。随后关闭真空泵。
1.4 使用无菌镊子将膜过滤器从装置中取出，将其过滤面朝上放置于无菌固化的大豆酪蛋白消化琼脂培养基表面，确保过滤器与培养基之间不产生气泡。
将培养板倒置，然后在30°C至35°C下培养5天。
1.6 培养5天后，检测所有滤膜。统计每个滤膜上形成菌落的单位总数（即cfu/ml数值）。
1.7 测定酵母菌与霉菌时，应使用添加了抗生素的沙保尔氏氯霉素琼脂/沙保尔氏葡萄糖琼脂而非 大豆酪蛋白消化琼脂。采用与总菌数检测相似的步骤，将培养皿置于20℃至25℃下培养5天，检查是否存在微生物生长。
2.0 倒板法（替代方法）：
2.1 对于纯化水及原水，将1 ml样品分两份加入无菌培养皿中，再倒入15 ml至20 ml无菌溶液。 大豆酪蛋白消化琼脂（在45℃下冷却）。充分混合并让培养基凝固。
2.2 将培养皿倒置后置于30°C至35°C环境下培养5天。培养结束后检测培养皿中的总细菌数，取两个培养皿中的最高数值，进而计算水样中每毫升的菌落形成单位数。
B. 病原体检测：
将100毫升样品通过0.45 µ的膜过滤器过滤。将该膜过滤器置于100毫升的无菌大豆酪蛋白消化培养基中，于30-35°C下培养24小时。
1.0 大肠埃希菌的检测：
在无菌麦康凯琼脂培养基表面划涂一部分富集大豆酪蛋白消化液培养基。
将培养板在30-35 °C下培养18-72小时。
1.3 培养后，麦康凯琼脂上出现砖红色菌落即表明存在大肠埃希菌。
1.4 将菌落涂布在Levine伊红亚甲蓝琼脂培养基表面，进一步开展确认试验。
具有金属光泽的1.5蓝黑色菌落可证实存在大肠埃希菌。
2.0 沙门氏菌的检测：
2.1 将0.1 ml富集大豆酪蛋白消化培养基转移至10 ml的Rappaport Vassiliadis培养基中。 沙门氏菌富集肉汤，在30-35℃下培养24-48小时。
2.2 在Wilson和Blair的BBS琼脂培养板表面将菌落划线于培养基上方，然后在30-35°C下培养24-48小时。
2.3 以空白区域为中心的绿色菌落会在48小时内逐渐变为均匀的黑色。若菌落周围存在暗色环带并伴有金属光泽，则提示可能存在沙门氏菌。
2.4 若在培养皿上进行传代培养则 将样品置于木糖-赖氨酸-脱氧胆酸盐琼脂上，在30-35℃下培养24-48小时。若出现生长良好的红色菌落，无论是否有黑色中心，均提示可能存在沙门氏菌。
2.5 将菌落涂布在表面以进行进一步确认。 首先在斜面培养基表面接种，再用同一支接种针进行穿刺培养，同时在一支尿素肉汤管中接种样本。将培养物置于30-35°C下培养18至24小时。若穿刺培养物出现酸生成及气体产生现象（可能伴有变黑），而三糖铁琼脂上的表面生长物无酸性反应，且尿素肉汤无红色出现，则表明存在沙门氏菌。
3.0 绿脓杆菌的检测：
3.1 将部分富集后的大豆酪蛋白消化培养基涂布在西曲米德琼脂培养基表面，然后在30-35°C下培养18至72小时。
3.2 绿色菌落可能表明存在铜绿假单胞菌。
3.3 通过色素试验和氧化酶试验进行进一步确认。
表1– 绿脓杆菌检测
| 序号 |
培养基
|
特征
形态学
|
荧光
在紫外光下
|
氧化酶试验
|
革兰氏染色法
|
1
|
用于检测荧光素的假单胞菌琼脂培养基
|
通常为无色至淡黄色
|
淡黄色
|
阳性结果
|
阴性菌杆
|
2
|
用于检测铜绿素的假单胞菌琼脂培养基。
|
通常情况下
淡绿色
|
蓝色
|
阳性结果
|
阴性菌杆
|
3.4 从西曲米德琼脂表面划取具有代表性的可疑菌落至荧光素检测用假单胞菌琼脂培养基表面，以及铜绿素检测用假单胞菌琼脂培养基表面。
3.5 盖上接种平板并将其倒置，然后在30-35°C下培养不少于3天。
3.6 在紫外光下观察带有条纹的表面。检查培养皿，确认是否存在符合表1描述的菌落。
3.7 若出现可疑菌落生长，取2至3滴新配制的1%（w/v）N,N,N溶液滴加于其上。1，N1将四甲基-4-苯二胺二盐酸盐涂于滤纸上并涂抹菌落，若无粉红色出现且未转为紫色，则说明该样品符合无铜绿假单胞菌的要求。
4.0 金黄色葡萄球菌的检测：
4.1 在甘露醇盐琼脂平板表面涂布一圈富集培养液大豆酪蛋白消化培养基。将平板置于30-35°C下培养18-72小时。培养结束后对平板进行观察。
4.2 若对培养后的平板进行观察，所有平板上均无带有黄色菌落的黄色区域，则该样品符合无金黄色葡萄球菌的要求。
4.3 若出现生长现象，需将菌落划线接种到表2所列培养基表面并进行培养，以进一步确认。 将培养皿置于30-35°C条件下培养48小时。
表2 金黄色葡萄球菌检测项目。
| 否。 |
选择性培养基
|
特征性菌落形态
|
1
|
沃格尔-约翰逊琼脂
|
黄色区域环绕的黑色区域
|
2
|
贝尔德-帕克琼脂
|
黑色、有光泽，周围环绕着2至5毫米宽的透明区域。
|
4.4 检查培养皿，判断菌落是否符合表2中的描述。若所有菌落均不具备表2中列出的特征，则该样品满足无金黄色葡萄球菌的检测要求。
5.0 肠杆菌科检测：
5.1 取10毫升转移 富集型流体大豆酪蛋白消化培养基 在装有90毫升无菌肠杆菌富集肉汤-Mossel的烧瓶中混合，然后在30-35ºC下培养24-48小时。
5.2 若在紫红胆汁葡萄糖琼脂培养板上观察到菌落生长，将该培养板置于30-35ºC下培养18-24小时。
5.3 观察培养皿，若发现有菌落，则对其进行革兰氏染色。若未观察到菌落，则该样品通过无肠杆菌检测。
5.4 若革兰氏染色检测到的阴性菌属于肠杆菌科细菌。
6.0 志贺菌的检测：
6.1 转移1毫升 的 将富集型液体大豆酪蛋白消化培养基与100毫升GN肉汤混合，然后在30至35°C下培养24至48小时。
6.2 在木糖赖氨酸脱氧胆酸盐琼脂培养板上，从GN肉汤中划取一环菌落。
6.3 将培养板在30-35 °C下培养24-48小时。
6.4 若出现无黑色核心的红色半透明菌落，则提示可能存在志贺氏菌。
6.5 若无微生物生长 观察到的该样品的检测结果合格。
7.0 梭菌的检测：
7.1 将100毫升样品在80℃下加热10分钟，随后迅速冷却。
7.2 通过无菌膜过滤装置对100毫升水样进行过滤。
7.3 使用无菌镊子将过滤器从装置中取出，并转移至100毫升容器中。 将培养基进行强化处理后，在无氧条件下于30-35°C下培养48小时。
7.4 培养完成后，划取部分富集菌株进行涂布。 哥伦比亚琼脂平板表面的加固培养基。
7.5 将培养板倒置，在无氧条件下于30-35°C下培养48小时。